Биоинформатика и Молекулна Еволюция

Преподавател: проф. д-р Роберт Пенчовски

Този курс подчертава еволюционните аспекти на биоинформатиката защото много от основните понятия в биоинформатиката, както търсене на сходство между ДНК, РНК и протеинови секвенции от различни видове, както и изграждане на филогенетични дървета, са тясно свързани с разбирането на молекулярната еволюция. Наличието на ДНК секвенции на цели геноми на много видове организми, предоставя на изследователите нови възможности за еволюционни изследвания. Биоинформатичната част от този курс обяснява използването на изчислителни методи в настоящата пост-геномна епоха за анализ на големи биологични бази данни включващи цели геноми, кодиращи и некодиращи РНКи, и протеини. Курсът обхваща и биоинформатични методи за анализ на индивидуални ДНК, РНК, и белтъчни молекули.

Еволюционната част от курса разглежда молекулярната еволюция на ниво ДНК, РНК и протеини последователности. Филогенетични методи са обхванати в подробности, както и примери за тяхното приложение при изследване на еволюцията. Курса представя в подробности различни методи за отриване на функционални части от генома базирани на анализ на молекулярна еволюция между различни видове организми. Освен това, особено място е обърнато на компютърно симулиране на молекулярна еволюция на функционални РНК молекули. В резултат от този курс у студентите ще се изграждат теоретични знания и практически умения за самостоятелен работа в областта на биоинформатиката и молекулярната еволюция, включително основни умения в използването на най-разпространения в биоинформатиката език за програмиране Perl.